Execution Chart

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Trace from the execution

Waiting for the VM to be ready (probing ssh)
................
/home/mcc/execution
total 888K
-rw-r--r-- 1 mcc users 3.9K May 15 18:54 CTLCardinality.txt
-rw-r--r-- 1 mcc users 22K May 15 18:54 CTLCardinality.xml
-rw-r--r-- 1 mcc users 2.6K May 15 18:54 CTLFireability.txt
-rw-r--r-- 1 mcc users 17K May 15 18:54 CTLFireability.xml
-rw-r--r-- 1 mcc users 4.0K May 15 18:50 GenericPropertiesDefinition.xml
-rw-r--r-- 1 mcc users 6.1K May 15 18:50 GenericPropertiesVerdict.xml
-rw-r--r-- 1 mcc users 2.6K May 26 09:26 LTLCardinality.txt
-rw-r--r-- 1 mcc users 12K May 26 09:26 LTLCardinality.xml
-rw-r--r-- 1 mcc users 1.8K May 26 09:26 LTLFireability.txt
-rw-r--r-- 1 mcc users 7.5K May 26 09:26 LTLFireability.xml
-rw-r--r-- 1 mcc users 3.3K May 15 18:54 ReachabilityCardinality.txt
-rw-r--r-- 1 mcc users 16K May 15 18:54 ReachabilityCardinality.xml
-rw-r--r-- 1 mcc users 113 May 15 18:54 ReachabilityDeadlock.txt
-rw-r--r-- 1 mcc users 351 May 15 18:54 ReachabilityDeadlock.xml
-rw-r--r-- 1 mcc users 2.5K May 15 18:54 ReachabilityFireability.txt
-rw-r--r-- 1 mcc users 13K May 15 18:54 ReachabilityFireability.xml
-rw-r--r-- 1 mcc users 1.7K May 15 18:54 UpperBounds.txt
-rw-r--r-- 1 mcc users 3.7K May 15 18:54 UpperBounds.xml
-rw-r--r-- 1 mcc users 6 May 15 18:50 equiv_col
-rw-r--r-- 1 mcc users 4 May 15 18:50 instance
-rw-r--r-- 1 mcc users 6 May 15 18:50 iscolored
-rw-r--r-- 1 mcc users 726K May 15 18:50 model.pnml
=====================================================================
Generated by BenchKit 2-3637
Executing tool irma4mcc-structural
Input is FlexibleBarrier-PT-14b, examination is LTLCardinality
Time confinement is 3600 seconds
Memory confinement is 16384 MBytes
Number of cores is 4
Run identifier is r247-blw7-152732549000051
=====================================================================

--------------------
content from stdout:

=== Data for post analysis generated by BenchKit (invocation template)

The expected result is a vector of booleans
BOOL_VECTOR

here is the order used to build the result vector(from text file)
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-00
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-01
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-02
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-03
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-04
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-05
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-06
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-07
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-08
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-09
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-10
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-11
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-12
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-13
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-14
FORMULA_NAME FlexibleBarrier-PT-14b-LTLCardinality-15

=== Now, execution of the tool begins

BK_START 1527944815296


BK_STOP 1527945569480

--------------------
content from stderr:

Prefix is 75f5f979.
Reading known information in /usr/share/mcc4mcc/75f5f979-known.json.
Reading learned information in /usr/share/mcc4mcc/75f5f979-learned.json.
Reading value translations in /usr/share/mcc4mcc/75f5f979-values.json.
Using directory /home/mcc/execution for input, as it contains a model.pnml file.
Using FlexibleBarrier-PT-14b as instance name.
Using FlexibleBarrier as model name.
Using algorithm or tool bmdt.
Model characteristics are: {'Examination': 'LTLCardinality', 'Place/Transition': True, 'Colored': False, 'Relative-Time': 1, 'Relative-Memory': 1, 'Ordinary': True, 'Simple Free Choice': False, 'Extended Free Choice': False, 'State Machine': False, 'Marked Graph': False, 'Connected': True, 'Strongly Connected': False, 'Source Place': True, 'Sink Place': False, 'Source Transition': False, 'Sink Transition': False, 'Loop Free': None, 'Conservative': False, 'Sub-Conservative': False, 'Nested Units': True, 'Safe': True, 'Deadlock': None, 'Reversible': None, 'Quasi Live': None, 'Live': None}.
Known tools are: [{'Time': 1406711, 'Memory': 15929.56, 'Tool': 'itstools'}, {'Time': 2355674, 'Memory': 3854.74, 'Tool': 'lola'}].
Learned tools are: [{'Tool': 'lola'}].
Learned tool lola is 1.6745969854504585x far from the best tool itstools.
LTLCardinality itstools FlexibleBarrier-PT-14b...
Jun 02, 2018 1:07:00 PM fr.lip6.move.gal.application.Application start
INFO: Running its-tools with arguments : [-z3path, /usr/bin/z3, -yices2path, /usr/bin/yices, -ltsminpath, /usr/bin, -smt, -its, -pnfolder, /mcc-data, -examination, LTLCardinality]
Jun 02, 2018 1:07:00 PM fr.lip6.move.gal.application.MccTranslator transformPNML
INFO: Parsing pnml file : /mcc-data/model.pnml
Jun 02, 2018 1:07:00 PM fr.lip6.move.gal.nupn.PTNetReader loadFromXML
INFO: Load time of PNML (sax parser for PT used): 118 ms
Jun 02, 2018 1:07:00 PM fr.lip6.move.gal.pnml.togal.PTGALTransformer handlePage
INFO: Transformed 2678 places.
Jun 02, 2018 1:07:00 PM fr.lip6.move.gal.pnml.togal.PTGALTransformer handlePage
INFO: Transformed 3085 transitions.
Jun 02, 2018 1:07:00 PM fr.lip6.move.gal.pnml.togal.PnmlToGalTransformer transform
INFO: Found NUPN structural information;
Jun 02, 2018 1:07:00 PM fr.lip6.move.serialization.SerializationUtil systemToFile
INFO: Time to serialize gal into /mcc-data/model.pnml.img.gal : 27 ms
Jun 02, 2018 1:07:00 PM fr.lip6.move.gal.application.MccTranslator applyOrder
INFO: Applying decomposition
Jun 02, 2018 1:07:00 PM fr.lip6.move.gal.instantiate.CompositeBuilder decomposeWithOrder
INFO: Decomposing Gal with order
Jun 02, 2018 1:07:01 PM fr.lip6.move.gal.instantiate.GALRewriter flatten
INFO: Flatten gal took : 347 ms
Jun 02, 2018 1:07:01 PM fr.lip6.move.gal.instantiate.CompositeBuilder rewriteArraysToAllowPartition
INFO: Rewriting arrays to variables to allow decomposition.
Jun 02, 2018 1:07:01 PM fr.lip6.move.gal.instantiate.Instantiator fuseIsomorphicEffects
INFO: Removed a total of 91 redundant transitions.
Using solver Z3 to compute partial order matrices.
Built C files in :
/mcc-data
Jun 02, 2018 1:07:01 PM fr.lip6.move.serialization.SerializationUtil systemToFile
INFO: Time to serialize gal into /mcc-data/LTLCardinality.pnml.gal : 13 ms
Jun 02, 2018 1:07:01 PM fr.lip6.move.serialization.SerializationUtil serializePropertiesForITSLTLTools
INFO: Time to serialize properties into /mcc-data/LTLCardinality.ltl : 2 ms
Invoking ITS tools like this :CommandLine [args=[/usr/share/itscl/plugins/fr.lip6.move.gal.itstools.binaries_1.0.0.201804131302/bin/its-ltl-linux64, --gc-threshold, 2000000, -i, /mcc-data/LTLCardinality.pnml.gal, -t, CGAL, -LTL, /mcc-data/LTLCardinality.ltl, -c, -stutter-deadlock], workingDir=/mcc-data]

its-ltl command run as :

/usr/share/itscl/plugins/fr.lip6.move.gal.itstools.binaries_1.0.0.201804131302/bin/its-ltl-linux64 --gc-threshold 2000000 -i /mcc-data/LTLCardinality.pnml.gal -t CGAL -LTL /mcc-data/LTLCardinality.ltl -c -stutter-deadlock
Read 16 LTL properties
Checking formula 0 : !((F((F("(u17.p536>=2)"))U(G("((u29.p2566==0)||(u18.p576==1))")))))
Formula 0 simplified : !F(F"(u17.p536>=2)" U G"((u29.p2566==0)||(u18.p576==1))")
built 134 ordering constraints for composite.
Jun 02, 2018 1:07:02 PM fr.lip6.move.gal.semantics.DeterministicNextBuilder getDeterministicNext
INFO: Input system was already deterministic with 3085 transitions.
Presburger conditions satisfied. Using coverability to approximate state space in K-Induction.
// Phase 1: matrix 3085 rows 2678 cols
Jun 02, 2018 1:07:05 PM fr.lip6.move.gal.gal2smt.bmc.KInductionSolver computeAndDeclareInvariants
INFO: Computed 16 place invariants in 2042 ms
invariant :u17:p410 + u17:p411 + u17:p412 + u17:p413 + u17:p414 + u17:p415 + u17:p416 + u17:p417 + u17:p418 + u17:p419 + u17:p420 + u17:p421 + u17:p422 + u17:p423 + u17:p424 + u17:p425 + u17:p426 + u17:p427 + u17:p428 + u17:p429 + u17:p430 + u17:p431 + u17:p432 + u17:p433 + u17:p434 + u17:p435 + u17:p436 + u17:p437 + u17:p438 + u17:p439 + u17:p440 + u17:p441 + u17:p442 + u17:p443 + u17:p444 + u17:p445 + u17:p446 + u17:p447 + u17:p448 + u17:p449 + u17:p450 + u17:p451 + u17:p452 + u17:p453 + u17:p454 + u17:p455 + u17:p456 + u17:p457 + u17:p458 + u17:p459 + u17:p460 + u17:p461 + u17:p462 + u17:p463 + u17:p464 + u17:p465 + u17:p466 + u17:p467 + u17:p468 + u17:p469 + u17:p470 + u17:p471 + u17:p472 + u17:p473 + u17:p474 + u17:p475 + u17:p476 + u17:p477 + u17:p478 + u17:p479 + u17:p480 + u17:p481 + u17:p482 + u17:p483 + u17:p484 + u17:p485 + u17:p486 + u17:p487 + u17:p488 + u17:p489 + u17:p490 + u17:p491 + u17:p492 + u17:p493 + u17:p494 + u17:p495 + u17:p496 + u17:p497 + u17:p498 + u17:p499 + u17:p500 + u17:p501 + u17:p502 + u17:p503 + u17:p504 + u17:p505 + u17:p506 + u17:p507 + u17:p508 + u17:p509 + u17:p510 + u17:p511 + u17:p512 + u17:p513 + u17:p514 + u17:p515 + u17:p516 + u17:p517 + u17:p518 + u17:p519 + u17:p520 + u17:p521 + u17:p522 + u17:p523 + u17:p524 + u17:p525 + u17:p526 + u17:p527 + u17:p528 + u17:p529 + u17:p530 + u17:p531 + u17:p532 + u17:p533 + u17:p534 + u17:p535 + u17:p536 + u17:p537 + u17:p538 + u17:p539 + u17:p540 + u17:p541 + u31:p11 + u32:p10 + u44:p9 + u43:p8 + u42:p7 + u41:p6 + u40:p5 + u39:p4 + u38:p3 + u37:p2 + u36:p1 + u35:p0 = 1
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INFO: Computation of co-enabling matrix(2/3085) took 2202 ms. Total solver calls (SAT/UNSAT): 6602(0/6602)
Jun 02, 2018 1:07:14 PM fr.lip6.move.gal.gal2smt.bmc.NecessaryEnablingsolver printStats
INFO: Computation of co-enabling matrix(9/3085) took 5521 ms. Total solver calls (SAT/UNSAT): 18432(0/18432)
SMT solver raised 'unknown', retrying with same input.
SMT solver raised 'unknown' twice, overapproximating result to 1.
Jun 02, 2018 1:07:18 PM fr.lip6.move.gal.gal2smt.bmc.NecessaryEnablingsolver printStats
INFO: Computation of co-enabling matrix(16/3085) took 9103 ms. Total solver calls (SAT/UNSAT): 22233(14/22219)
Jun 02, 2018 1:07:18 PM fr.lip6.move.gal.gal2smt.bmc.NecessaryEnablingsolver printStats
INFO: Computation of Finished co-enabling matrix. took 9937 ms. Total solver calls (SAT/UNSAT): 22233(14/22219)
Jun 02, 2018 1:07:19 PM fr.lip6.move.gal.gal2smt.bmc.NecessaryEnablingsolver computeDoNotAccord
INFO: Computing Do-Not-Accords matrix : 3085 transitions.
Jun 02, 2018 1:09:58 PM fr.lip6.move.gal.gal2smt.bmc.NecessaryEnablingsolver printStats
INFO: Computation of Completed DNA matrix. took 159220 ms. Total solver calls (SAT/UNSAT): 62928(0/62928)
Jun 02, 2018 1:09:59 PM fr.lip6.move.gal.gal2pins.Gal2PinsTransformerNext transform
INFO: Built C files in 177151ms conformant to PINS in folder :/mcc-data
Running compilation step : CommandLine [args=[gcc, -c, -I/usr/bin/include, -I., -std=c99, -fPIC, -O3, model.c], workingDir=/mcc-data]
java.io.IOException: Cannot run program "gcc" (in directory "/mcc-data"): error=2, No such file or directory
at java.lang.ProcessBuilder.start(ProcessBuilder.java:1048)
at fr.lip6.move.gal.process.Runner.runTool(Runner.java:46)
at fr.lip6.move.gal.process.Runner.runTool(Runner.java:27)
at fr.lip6.move.gal.application.LTSminRunner.compilePINS(LTSminRunner.java:235)
at fr.lip6.move.gal.application.LTSminRunner.access$6(LTSminRunner.java:220)
at fr.lip6.move.gal.application.LTSminRunner$1.run(LTSminRunner.java:75)
at java.lang.Thread.run(Thread.java:748)
Caused by: java.io.IOException: error=2, No such file or directory
at java.lang.UNIXProcess.forkAndExec(Native Method)
at java.lang.UNIXProcess.(UNIXProcess.java:247)
at java.lang.ProcessImpl.start(ProcessImpl.java:134)
at java.lang.ProcessBuilder.start(ProcessBuilder.java:1029)
... 6 more
ITS-tools command line returned an error code 139
!SESSION 2018-06-02 13:06:57.968 -----------------------------------------------
eclipse.buildId=4.7.2.M20171130-0510
java.version=1.8.0_162
java.vendor=Oracle Corporation
BootLoader constants: OS=linux, ARCH=x86_64, WS=gtk, NL=en_US
Framework arguments: -application fr.lip6.move.gal.application.pnmcc -z3path /usr/bin/z3 -yices2path /usr/bin/yices -ltsminpath /usr/bin -smt -its -pnfolder /mcc-data -examination LTLCardinality
Command-line arguments: -application fr.lip6.move.gal.appli

Sequence of Actions to be Executed by the VM

This is useful if one wants to reexecute the tool in the VM from the submitted image disk.

set -x
# this is for BenchKit: configuration of major elements for the test
export BK_INPUT="FlexibleBarrier-PT-14b"
export BK_EXAMINATION="LTLCardinality"
export BK_TOOL="irma4mcc-structural"
export BK_RESULT_DIR="/tmp/BK_RESULTS/OUTPUTS"
export BK_TIME_CONFINEMENT="3600"
export BK_MEMORY_CONFINEMENT="16384"

# this is specific to your benchmark or test

export BIN_DIR="$HOME/BenchKit/bin"

# remove the execution directoty if it exists (to avoid increse of .vmdk images)
if [ -d execution ] ; then
rm -rf execution
fi

tar xzf /home/mcc/BenchKit/INPUTS/FlexibleBarrier-PT-14b.tgz
mv FlexibleBarrier-PT-14b execution
cd execution
pwd
ls -lh

# this is for BenchKit: explicit launching of the test
echo "====================================================================="
echo " Generated by BenchKit 2-3637"
echo " Executing tool irma4mcc-structural"
echo " Input is FlexibleBarrier-PT-14b, examination is LTLCardinality"
echo " Time confinement is $BK_TIME_CONFINEMENT seconds"
echo " Memory confinement is 16384 MBytes"
echo " Number of cores is 4"
echo " Run identifier is r247-blw7-152732549000051"
echo "====================================================================="
echo
echo "--------------------"
echo "content from stdout:"
echo
echo "=== Data for post analysis generated by BenchKit (invocation template)"
echo
if [ "LTLCardinality" = "UpperBounds" ] ; then
echo "The expected result is a vector of positive values"
echo NUM_VECTOR
elif [ "LTLCardinality" != "StateSpace" ] ; then
echo "The expected result is a vector of booleans"
echo BOOL_VECTOR
else
echo "no data necessary for post analysis"
fi
echo
if [ -f "LTLCardinality.txt" ] ; then
echo "here is the order used to build the result vector(from text file)"
for x in $(grep Property LTLCardinality.txt | cut -d ' ' -f 2 | sort -u) ; do
echo "FORMULA_NAME $x"
done
elif [ -f "LTLCardinality.xml" ] ; then # for cunf (txt files deleted;-)
echo echo "here is the order used to build the result vector(from xml file)"
for x in $(grep '' LTLCardinality.xml | cut -d '>' -f 2 | cut -d '<' -f 1 | sort -u) ; do
echo "FORMULA_NAME $x"
done
fi
echo
echo "=== Now, execution of the tool begins"
echo
echo -n "BK_START "
date -u +%s%3N
echo
timeout -s 9 $BK_TIME_CONFINEMENT bash -c "/home/mcc/BenchKit/BenchKit_head.sh 2> STDERR ; echo ; echo -n \"BK_STOP \" ; date -u +%s%3N"
if [ $? -eq 137 ] ; then
echo
echo "BK_TIME_CONFINEMENT_REACHED"
fi
echo
echo "--------------------"
echo "content from stderr:"
echo
cat STDERR ;